Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF34Q969K3 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms