Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HLA-CQ95604 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms