Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HERVK_113Q902F9 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms