Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SEMA6DQ8NFY4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms