Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MYRIPQ8NFW9 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYRIPQ8NFW9 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms