Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC82Q8N4S0 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms