Protein–RNA interactions for Protein: Q86V20

FAM35A, Protein FAM35A, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM35AQ86V20 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM35AQ86V20 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM35AQ86V20 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM35AQ86V20 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms