Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 374.5 ms