Protein–RNA interactions for Protein: Q5JST6

EFHC2, EF-hand domain-containing family member C2, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC2Q5JST6 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EFHC2Q5JST6 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHC2Q5JST6 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHC2Q5JST6 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHC2Q5JST6 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EFHC2Q5JST6 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms