Protein–RNA interactions for Protein: Q5FBB7

SGO1, Shugoshin 1, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1Q5FBB7 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SGO1Q5FBB7 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SGO1Q5FBB7 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SGO1Q5FBB7 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SGO1Q5FBB7 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGO1Q5FBB7 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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