Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFT2D3Q587I9 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms