Protein–RNA interactions for Protein: Q56A73

SPIN4, Spindlin-4, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN4Q56A73 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPIN4Q56A73 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms