Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms