Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNOP1Q1ED39 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNOP1Q1ED39 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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