Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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PDK4Q16654 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
PDK4Q16654 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDK4Q16654 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDK4Q16654 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDK4Q16654 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDK4Q16654 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDK4Q16654 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDK4Q16654 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDK4Q16654 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDK4Q16654 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDK4Q16654 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDK4Q16654 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDK4Q16654 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDK4Q16654 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDK4Q16654 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PDK4Q16654 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDK4Q16654 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PDK4Q16654 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PDK4Q16654 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PDK4Q16654 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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PDK4Q16654 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PDK4Q16654 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PDK4Q16654 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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PDK4Q16654 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDK4Q16654 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDK4Q16654 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDK4Q16654 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDK4Q16654 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PDK4Q16654 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDK4Q16654 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDK4Q16654 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDK4Q16654 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PDK4Q16654 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PDK4Q16654 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDK4Q16654 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDK4Q16654 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDK4Q16654 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDK4Q16654 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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