Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RPE65Q16518 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RPE65Q16518 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RPE65Q16518 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RPE65Q16518 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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RPE65Q16518 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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RPE65Q16518 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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RPE65Q16518 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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RPE65Q16518 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RPE65Q16518 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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