Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms