Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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