Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TAF13Q15543 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms