Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRRQ15256 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRRQ15256 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms