Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GAPVD1Q14C86 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms