Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RFTN1Q14699 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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