Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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