Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CAPSQ13938 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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CAPSQ13938 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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CAPSQ13938 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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CAPSQ13938 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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CAPSQ13938 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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CAPSQ13938 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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CAPSQ13938 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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CAPSQ13938 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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CAPSQ13938 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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CAPSQ13938 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAPSQ13938 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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