Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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DDX39BQ13838 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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DDX39BQ13838 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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DDX39BQ13838 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DDX39BQ13838 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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DDX39BQ13838 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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DDX39BQ13838 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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DDX39BQ13838 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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DDX39BQ13838 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DDX39BQ13838 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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