Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTAN1Q13813 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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