Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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TOP3AQ13472 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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TOP3AQ13472 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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TOP3AQ13472 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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TOP3AQ13472 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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TOP3AQ13472 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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TOP3AQ13472 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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TOP3AQ13472 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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TOP3AQ13472 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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TOP3AQ13472 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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TOP3AQ13472 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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TOP3AQ13472 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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TOP3AQ13472 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TOP3AQ13472 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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