Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
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CBX3Q13185 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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CBX3Q13185 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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CBX3Q13185 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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CBX3Q13185 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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CBX3Q13185 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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CBX3Q13185 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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CBX3Q13185 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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CBX3Q13185 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBX3Q13185 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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