Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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IFT88Q13099 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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IFT88Q13099 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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IFT88Q13099 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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IFT88Q13099 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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IFT88Q13099 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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IFT88Q13099 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IFT88Q13099 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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