Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP3Q12983 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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