Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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FOXF1Q12946 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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FOXF1Q12946 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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FOXF1Q12946 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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FOXF1Q12946 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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FOXF1Q12946 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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FOXF1Q12946 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXF1Q12946 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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