Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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PTPN13Q12923 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PTPN13Q12923 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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