Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC15Q0P6D6 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms