Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NIPAL4Q0D2K0 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms