Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms