Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC18A2Q05940 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC18A2Q05940 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms