Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHRNB3Q05901 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNB3Q05901 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms