Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIN1Q05586 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIN1Q05586 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms