Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP27A1Q02318 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms