Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
OTUD4Q01804 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms