Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MS4A2Q01362 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms