Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CACNA1BQ00975 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 PRDX2-202ENST00000334482 784 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 AC007881.1-201ENST00000437460 187 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CACNA1BQ00975 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms