Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RBP5P82980 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RBP5P82980 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RBP5P82980 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBP5P82980 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RBP5P82980 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms