Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SIM1P81133 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SIM1P81133 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SIM1P81133 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SIM1P81133 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SIM1P81133 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SIM1P81133 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SIM1P81133 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SIM1P81133 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SIM1P81133 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SIM1P81133 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SIM1P81133 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SIM1P81133 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SIM1P81133 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SIM1P81133 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SIM1P81133 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SIM1P81133 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SIM1P81133 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SIM1P81133 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SIM1P81133 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SIM1P81133 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SIM1P81133 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SIM1P81133 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SIM1P81133 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SIM1P81133 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SIM1P81133 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SIM1P81133 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SIM1P81133 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SIM1P81133 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SIM1P81133 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SIM1P81133 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SIM1P81133 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SIM1P81133 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SIM1P81133 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SIM1P81133 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SIM1P81133 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SIM1P81133 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SIM1P81133 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.05■□□□□ -0
SIM1P81133 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms