Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX4P78413 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX4P78413 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX4P78413 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX4P78413 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX4P78413 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX4P78413 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX4P78413 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX4P78413 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX4P78413 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX4P78413 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX4P78413 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX4P78413 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX4P78413 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX4P78413 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX4P78413 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX4P78413 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX4P78413 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX4P78413 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX4P78413 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX4P78413 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX4P78413 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX4P78413 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX4P78413 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX4P78413 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX4P78413 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX4P78413 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX4P78413 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX4P78413 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX4P78413 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX4P78413 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX4P78413 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX4P78413 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX4P78413 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX4P78413 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX4P78413 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX4P78413 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX4P78413 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX4P78413 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX4P78413 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX4P78413 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX4P78413 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX4P78413 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX4P78413 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX4P78413 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX4P78413 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX4P78413 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX4P78413 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX4P78413 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRX4P78413 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms