Protein–RNA interactions for Protein: P56704

WNT3A, Protein Wnt-3a, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT3AP56704 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
WNT3AP56704 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
WNT3AP56704 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
WNT3AP56704 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
WNT3AP56704 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
WNT3AP56704 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
WNT3AP56704 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
WNT3AP56704 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WNT3AP56704 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
WNT3AP56704 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
WNT3AP56704 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WNT3AP56704 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WNT3AP56704 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
WNT3AP56704 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms