Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SH3BGRP55822 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms