Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEC13P55735 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.39■□□□□ 0.06
SEC13P55735 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC13P55735 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC13P55735 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC13P55735 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC13P55735 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC13P55735 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC13P55735 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC13P55735 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC13P55735 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC13P55735 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC13P55735 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC13P55735 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC13P55735 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC13P55735 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC13P55735 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC13P55735 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC13P55735 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC13P55735 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC13P55735 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC13P55735 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC13P55735 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC13P55735 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC13P55735 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC13P55735 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC13P55735 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC13P55735 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC13P55735 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC13P55735 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC13P55735 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC13P55735 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC13P55735 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC13P55735 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC13P55735 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC13P55735 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC13P55735 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC13P55735 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC13P55735 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC13P55735 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEC13P55735 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC13P55735 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC13P55735 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC13P55735 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC13P55735 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC13P55735 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC13P55735 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC13P55735 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC13P55735 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC13P55735 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC13P55735 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC13P55735 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC13P55735 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC13P55735 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC13P55735 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC13P55735 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEC13P55735 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms