Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB28P51157 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB28P51157 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB28P51157 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB28P51157 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB28P51157 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB28P51157 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB28P51157 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB28P51157 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB28P51157 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB28P51157 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB28P51157 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB28P51157 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB28P51157 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB28P51157 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB28P51157 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB28P51157 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB28P51157 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB28P51157 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB28P51157 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB28P51157 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB28P51157 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB28P51157 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB28P51157 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB28P51157 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB28P51157 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB28P51157 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB28P51157 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB28P51157 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB28P51157 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB28P51157 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB28P51157 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB28P51157 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB28P51157 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB28P51157 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB28P51157 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB28P51157 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB28P51157 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB28P51157 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB28P51157 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB28P51157 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB28P51157 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB28P51157 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB28P51157 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB28P51157 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB28P51157 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB28P51157 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms