Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP4P49662 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP4P49662 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP4P49662 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP4P49662 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP4P49662 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP4P49662 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP4P49662 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP4P49662 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP4P49662 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP4P49662 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP4P49662 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP4P49662 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP4P49662 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP4P49662 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP4P49662 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP4P49662 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP4P49662 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP4P49662 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP4P49662 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP4P49662 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP4P49662 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP4P49662 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP4P49662 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP4P49662 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP4P49662 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP4P49662 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP4P49662 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP4P49662 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP4P49662 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP4P49662 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP4P49662 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP4P49662 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP4P49662 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP4P49662 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP4P49662 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP4P49662 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP4P49662 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP4P49662 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP4P49662 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP4P49662 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP4P49662 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP4P49662 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP4P49662 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP4P49662 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP4P49662 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP4P49662 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASP4P49662 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP4P49662 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP4P49662 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP4P49662 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP4P49662 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP4P49662 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP4P49662 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP4P49662 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CASP4P49662 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms